D. Tujuan Pendidikan Madrasah
Secara umum, tujuan pendidikan Madrasah Aliyah Salafiyah Pekalongan adalah meletakkan dasar kecerdasan, pengetahuan, kepribadian, akhlak mulia serta keterampilan untuk hidup mandiri dan mengikuti pendidikan lebih lanjut. Bertolak dari tujuan umum pendidikan menengah tersebut, Madrasah Aliyah Salafiyah Pekalongan mempunyai tujuan sebagai berikut :
1. Mengoptimalkan proses pembelajaran dengan menggunakan pendekatan Pembelajaran Aktif (PAKEM, CTL).
2. Mengembangkan potensi akademik, minat dan bakat Peserta Didik melalui layanan bimbingan dan konseling dan kegiatan ekstra kurikuler
3. Membiasakan perilaku Islami ala Ahlus Sunnah Wal Jama’ah di lingkungan madrasah
4. Meningkatkan prestasi akademik Peserta Didik dengan nilai rata-rata 7,5
5. Meningkatkan prestasi akademik Peserta Didik di bidang seni dan olehraga lewat kejuaraan dan kompetisi.
6. Mempersiapkan peserta didik untuk mengikuti pendidikan lebih lanjut.
7. Mempersiapkan bekal ketrampilan dan kemampuan menggunakan IPTEK peserta didik untuk hidup mandiri di masyarakat sebagai perwujudan pengabdian kepada Allah SWT